El origen de estas aves ha planteado numerosas interrogantes. Como los mapuches no tenían escritura no hay registros precolombinos sobre esta gallina. Sólo se conservan crónicas de alrededor del año 1500, que dan cuenta de la crianza de gallinas por parte de los "indios araucanos", de una raza distinta a la europea.
Antiguamente la principal controversia era si estas gallinas existían antes de que llegaran los españoles al continente. Antes del 2007 había científicos que indicaban que no se tenía ningún indicio en este sentido y que los primeros ejemplares, originarios de Persia o Ceilán, pudieron haber sido introducidos por los piratas europeos al inicio de la Conquista. Sín embargo otros plantearon que podrían haber sido traídas por migraciones polinésicas antes de la llegada de los europeos; y esta última hipótesis toma fuerza cuando a principios de junio del año 2007, antropólogos chilenos y neozelandeses, anunciaron haber encontrado unos 50 huesos de pollo en el sitio arqueológico de El Arenal, al sur del Chile. El análisis genético de uno de ellos demostró que pertenecían a especies polinesias, y que llegaron a la zona al menos 100 años antes que los españoles. Esto abre nuevas teorías respecto al origen de la gallina araucana.
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